31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4548 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  100 
 
 		 462 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  37.81 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  40 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  40.5 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  35.21 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  39.02 
 
 		 454 aa  203  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  38.7 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  39.52 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  37.67 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  37.33 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  32.49 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  34.55 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  31.44 
 
 		 400 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  32.59 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  31.34 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  29.21 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  29.01 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  28.07 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  28.12 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  27.49 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  31.68 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  29.94 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  28.99 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  27.78 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  30.58 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  29.39 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  30.16 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  30.16 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  30.16 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  26.82 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>