31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3210 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  819    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  72.15 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  70.02 
 
 
425 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  70.27 
 
 
425 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  70.27 
 
 
425 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  60.05 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  43.11 
 
 
432 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  36.07 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  33.24 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  33.05 
 
 
498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  34.23 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  31.34 
 
 
442 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  30.28 
 
 
471 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  34.38 
 
 
435 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  31.6 
 
 
433 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  32.36 
 
 
417 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  29.92 
 
 
471 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  29.81 
 
 
400 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  33.44 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  30.28 
 
 
462 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  33.98 
 
 
369 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  29.84 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  33.22 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  33.65 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  34.71 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  35.05 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  30.7 
 
 
501 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  28.66 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  25.34 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  30.12 
 
 
723 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  23.21 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>