32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  50.88 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  52.06 
 
 		 471 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  46.22 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  46.04 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  50 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  39.34 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  37.8 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  38.59 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  39.11 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  36.57 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  35.82 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  36.29 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  36.31 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  38.78 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  34.32 
 
 		 377 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  34.34 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  33.61 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  32.83 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  31.69 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.09 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  33.41 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  35.93 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  31.15 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  31.95 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  31.95 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  32.5 
 
 		 723 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  33.51 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  37.25 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  32.73 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  30.69 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 703 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.798667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>