30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5060 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  30.18 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  34.27 
 
 
435 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  30.3 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  29.02 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  31.69 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  32.19 
 
 
498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  29.21 
 
 
462 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  28.91 
 
 
501 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  28.88 
 
 
381 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  30.13 
 
 
442 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  29.38 
 
 
471 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  30.41 
 
 
442 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  29.9 
 
 
454 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  29.18 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  31.52 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  28.53 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  37.07 
 
 
445 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  29.32 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  27.63 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  26.79 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  26.39 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  27.88 
 
 
723 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  27.98 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  21.31 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  26.96 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  25.87 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  25.37 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  25.37 
 
 
425 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  25.37 
 
 
425 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>