20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1615 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  38.07 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  36.11 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  38.98 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.01 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  28.65 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.65 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3014  hypothetical protein  35.93 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3822  hypothetical protein  38.1 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1893  hypothetical protein  39.06 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227105  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  33.85 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  33.85 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  32.31 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.23 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  41.51 
 
 		 171 aa  42  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  32.79 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>