23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0995 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.48 
 
 
173 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  43.93 
 
 
184 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  40.24 
 
 
169 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  43.2 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  42.01 
 
 
174 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  30.77 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.77 
 
 
144 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3014  hypothetical protein  39.16 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  27.21 
 
 
418 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 
392 aa  48.5  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
400 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 
387 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
402 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 
387 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
402 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.19 
 
 
396 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  42.22 
 
 
404 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
387 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  20.83 
 
 
387 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.66 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
387 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>