13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5352 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
173 aa  340  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  48.48 
 
 
201 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  48.48 
 
 
172 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  48.26 
 
 
184 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  43.75 
 
 
169 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3014  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  38.01 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  41.57 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  32.74 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.74 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
400 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0211  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.38 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.48876e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1893  hypothetical protein  38.98 
 
 
165 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227105  normal  0.274153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>