10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1002 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  46.15 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  46.47 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.26 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  44.51 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  43.58 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  37.43 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3014  hypothetical protein  41.76 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  30.23 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.23 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>