10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3013 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  45.88 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  45.4 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3014  hypothetical protein  48.47 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  40.24 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.75 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  37.65 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.22 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  27.22 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>