14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0646 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  100 
 
 
171 aa  349  1e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1764  flavodoxin family protein  44.05 
 
 
169 aa  150  8e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  41.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1177  flavodoxin family protein  39.41 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.392318  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0527  flavodoxin family protein  34.71 
 
 
180 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0211  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.98 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.48876e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1284  hypothetical protein  41.07 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.016048  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0999  hypothetical protein  35.87 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000710305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  39.13 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  27.12 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  30.7 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.7 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 
159 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>