17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0589 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1177  flavodoxin family protein  50 
 
 
167 aa  168  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.392318  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1764  flavodoxin family protein  43.29 
 
 
169 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  41.92 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0527  flavodoxin family protein  39.87 
 
 
180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0211  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.57 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.48876e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11410  hypothetical protein  29.68 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2502  hypothetical protein  27.38 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  32.94 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  29.06 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  27.94 
 
 
178 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  26.55 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  25.49 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.55 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  23.26 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.81 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  29.81 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>