14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0999 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0999  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  362  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000710305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1284  hypothetical protein  31.61 
 
 
188 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.016048  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0634  hypothetical protein  35.59 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0534291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  87.4  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3493  hypothetical protein  30.9 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.67 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3142  hypothetical protein  26.9 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000238229  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0585  hypothetical protein  26.7 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0400292  decreased coverage  0.000284445 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1764  flavodoxin family protein  36.08 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  35.87 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  30.07 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  27.81 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  27.01 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  31.82 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>