17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3822 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3822  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1893  hypothetical protein  79.22 
 
 
165 aa  259  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227105  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  25 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  38.1 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  26.14 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  26.97 
 
 
574 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  25.2 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.49 
 
 
762 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  25.2 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  27.93 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>