33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3560 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  42.94 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  41.83 
 
 
492 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  47.48 
 
 
162 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2866  hypothetical protein  31.61 
 
 
348 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0921  hypothetical protein  30.77 
 
 
348 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0193963  hitchhiker  0.0000000187987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1090  hypothetical protein  31.29 
 
 
358 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1828  hypothetical protein  31.48 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000118361  hitchhiker  0.00000000100515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2011  hypothetical protein  31.48 
 
 
348 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  hitchhiker  0.000417302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  46.97 
 
 
148 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5373  hypothetical protein  28.41 
 
 
351 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  42.22 
 
 
144 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  43.7 
 
 
137 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  42.22 
 
 
142 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  48.28 
 
 
193 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  43.85 
 
 
149 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  47.83 
 
 
195 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  40.3 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  43.08 
 
 
151 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  37.31 
 
 
151 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1808  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000172531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  39.84 
 
 
153 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  39.81 
 
 
149 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1656  hypothetical protein  28.41 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5560  hypothetical protein  27.33 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0912  hypothetical protein  24.23 
 
 
350 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.313061  hitchhiker  0.00000960214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6667  hypothetical protein  26.42 
 
 
342 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2269  hypothetical protein  23.26 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3166  hypothetical protein  26.26 
 
 
342 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.329234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>