16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2866 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0921  hypothetical protein  94.24 
 
 
348 aa  674    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0193963  hitchhiker  0.0000000187987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1090  hypothetical protein  94.69 
 
 
358 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1828  hypothetical protein  95.69 
 
 
351 aa  680    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000118361  hitchhiker  0.00000000100515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2011  hypothetical protein  93.1 
 
 
348 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  hitchhiker  0.000417302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2866  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  711    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  32.46 
 
 
492 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  31.35 
 
 
503 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  31.61 
 
 
507 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5373  hypothetical protein  30.41 
 
 
351 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1808  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000172531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1656  hypothetical protein  32.27 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5560  hypothetical protein  34.15 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0912  hypothetical protein  27.48 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.313061  hitchhiker  0.00000960214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6667  hypothetical protein  25.07 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3166  hypothetical protein  23.45 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.329234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2269  hypothetical protein  22.74 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>