33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3038 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1029    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  42.94 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  42.57 
 
 
492 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1828  hypothetical protein  32 
 
 
351 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000118361  hitchhiker  0.00000000100515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0921  hypothetical protein  31.67 
 
 
348 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0193963  hitchhiker  0.0000000187987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5373  hypothetical protein  29.48 
 
 
351 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2866  hypothetical protein  31.35 
 
 
348 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2011  hypothetical protein  32 
 
 
348 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  hitchhiker  0.000417302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1090  hypothetical protein  31.33 
 
 
358 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  45 
 
 
162 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  48.18 
 
 
148 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  42.96 
 
 
144 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  42.96 
 
 
137 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  45.53 
 
 
151 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1808  hypothetical protein  26.67 
 
 
341 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000172531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  41.79 
 
 
147 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  46.77 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  37.9 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  45.16 
 
 
193 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  46.55 
 
 
193 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  48.7 
 
 
195 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  43.55 
 
 
195 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  35.94 
 
 
150 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  37.04 
 
 
149 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  39.37 
 
 
153 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1656  hypothetical protein  29.31 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  30.23 
 
 
143 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0912  hypothetical protein  26.48 
 
 
350 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.313061  hitchhiker  0.00000960214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6667  hypothetical protein  25.24 
 
 
342 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5560  hypothetical protein  26.25 
 
 
369 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3166  hypothetical protein  22.87 
 
 
342 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.329234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2269  hypothetical protein  25.74 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>