20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4691 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  41.04 
 
 
148 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  40.6 
 
 
137 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  41.04 
 
 
142 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  39.84 
 
 
507 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  41.22 
 
 
492 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  40.32 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  39.37 
 
 
503 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  40.98 
 
 
151 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  33.83 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  37.88 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  35.11 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  38.76 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  38.52 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  38.52 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  38.94 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  31.2 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  35.9 
 
 
195 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  32.43 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>