20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1806 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  165  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  42.96 
 
 
503 aa  135  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  42.22 
 
 
507 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  43.7 
 
 
137 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  43.8 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  42.34 
 
 
492 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  39.69 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  39.71 
 
 
142 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  45.6 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  46.4 
 
 
195 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  46.21 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  45.6 
 
 
193 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  47.86 
 
 
195 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  46.61 
 
 
193 aa  113  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  34.31 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  33.83 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>