20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5558 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  51.91 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  48.51 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  49.62 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  45.83 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  41.26 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  39.71 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  42.22 
 
 		 507 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  37.9 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  39.37 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  40.15 
 
 		 492 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  41.04 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  36.8 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  38.58 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  37.01 
 
 		 193 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  37.01 
 
 		 195 aa  89.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  37.39 
 
 		 193 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  35.09 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>