18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2541 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  30.23 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  36.04 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  35.78 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  34.19 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  37.61 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  36.21 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  32.79 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  31.51 
 
 		 492 aa  67  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  31.4 
 
 		 507 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  32.43 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  28.83 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  34.21 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  29.2 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  28.7 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>