21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1654 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  165  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  47.48 
 
 
507 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  53.54 
 
 
149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  45 
 
 
503 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  48.46 
 
 
137 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  48.12 
 
 
151 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  49.62 
 
 
142 aa  140  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  50.39 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  47.06 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  50.39 
 
 
195 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  48.85 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  51.72 
 
 
193 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  40.3 
 
 
492 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  49.57 
 
 
195 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  32.37 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2541  hypothetical protein  34.19 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  32.19 
 
 
361 aa  40.8  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>