19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2009 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2009  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471756  hitchhiker  0.00189164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  95.85 
 
 
193 aa  380  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2864  hypothetical protein  89.95 
 
 
195 aa  352  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  90.67 
 
 
195 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  84 
 
 
149 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  51.2 
 
 
162 aa  137  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  44 
 
 
148 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  46.92 
 
 
507 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  47.2 
 
 
492 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1806  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  114  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.897355  hitchhiker  0.0000000117053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1033  hypothetical protein  39.53 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46402  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  45.53 
 
 
503 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0910  hypothetical protein  40.48 
 
 
151 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  hitchhiker  0.00000644776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3169  hypothetical protein  39.2 
 
 
147 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.744186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5558  hypothetical protein  37.1 
 
 
142 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3811  hypothetical protein  37.1 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6669  hypothetical protein  33.64 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4691  hypothetical protein  38.52 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.306809  hitchhiker  0.00137865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>