16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1828 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0921  hypothetical protein  94.81 
 
 		 348 aa  676    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0193963  hitchhiker  0.0000000187987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1090  hypothetical protein  92.74 
 
 		 358 aa  670    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000118361  hitchhiker  0.00000000100515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2011  hypothetical protein  94.54 
 
 		 348 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  hitchhiker  0.000417302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2866  hypothetical protein  95.69 
 
 		 348 aa  680    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4377  hypothetical protein  31.78 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3038  hypothetical protein  32 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5373  hypothetical protein  31.53 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  31.48 
 
 		 507 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1808  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000172531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1656  hypothetical protein  30.45 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0912  hypothetical protein  28.15 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.313061  hitchhiker  0.00000960214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5560  hypothetical protein  32.54 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6667  hypothetical protein  24.78 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3166  hypothetical protein  23.19 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.329234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2269  hypothetical protein  26.14 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>