21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1195 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  70.94 
 
 		 238 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  70.94 
 
 		 238 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0929  hypothetical protein  80.36 
 
 		 118 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  63.71 
 
 		 134 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2230  phage major tail subunit  50.68 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  39.16 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  37.06 
 
 		 174 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  35.77 
 
 		 154 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.64 
 
 		 14944 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  29.91 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 1132 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  38.16 
 
 		 1550 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  31.33 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  26.88 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1969 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  26.8 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.59 
 
 		 1176 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.44 
 
 		 887 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.89 
 
 		 1607 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  32.39 
 
 		 918 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>