16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1686 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  100 
 
 
152 aa  309  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  95.39 
 
 
174 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  80.69 
 
 
154 aa  246  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  39.16 
 
 
234 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  36.3 
 
 
238 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  36.3 
 
 
238 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2230  phage major tail subunit  33.6 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  32.14 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  34.31 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  34.69 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0929  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  25.42 
 
 
310 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  33.33 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  28.03 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  46.67 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>