16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2176 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  70.94 
 
 		 234 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0929  hypothetical protein  96.43 
 
 		 118 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  83.72 
 
 		 134 aa  224  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2230  phage major tail subunit  49.32 
 
 		 156 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  36.3 
 
 		 152 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  34.75 
 
 		 174 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  34.81 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.17 
 
 		 1607 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  42.5 
 
 		 1550 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  32.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.52 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.19 
 
 		 1507 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  27.84 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  26.58 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>