15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1640 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  67.13 
 
 		 216 aa  307  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  37.07 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  34.69 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  32.65 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  29.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  34.69 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2257  hypothetical protein  35.96 
 
 		 514 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2414  phage tail protein  26.98 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.029882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0637  hypothetical protein  27.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2783  hypothetical protein  28.18 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  27.61 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  27.27 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  27.84 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  27.84 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>