11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4087 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3408  tail protein 3  32.39 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2414  phage tail protein  32.87 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.029882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  31.31 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2783  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1625  hypothetical protein  32.38 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3247  tail protein 3  29.05 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000278412  hitchhiker  0.000000000411211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1779  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  27.7 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  28.04 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  27.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>