11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3247 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3247  tail protein 3  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000278412  hitchhiker  0.000000000411211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2414  phage tail protein  40.38 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.029882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  40.93 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3408  tail protein 3  36.02 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1625  hypothetical protein  38.12 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2783  hypothetical protein  37.38 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1779  hypothetical protein  46.94 
 
 		 152 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  30.69 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  29.05 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  26.63 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>