12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1689 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2414  phage tail protein  46.26 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.029882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2783  hypothetical protein  43.26 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3408  tail protein 3  39.72 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3247  tail protein 3  40.93 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000278412  hitchhiker  0.000000000411211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1779  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  32.87 
 
 		 306 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  31.31 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1625  hypothetical protein  34.11 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  29.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  27.06 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  26.44 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>