26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0012 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0012  IS3 family transposase  100 
 
 		 172 aa  359  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.581726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 505 aa  141  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  47.55 
 
 		 505 aa  141  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  45.07 
 
 		 512 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  49.65 
 
 		 510 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 515 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  42.36 
 
 		 512 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  42.36 
 
 		 512 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  42.36 
 
 		 512 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  46.15 
 
 		 288 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  40.28 
 
 		 512 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  39.86 
 
 		 548 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  37.58 
 
 		 533 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  36.36 
 
 		 514 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  41.55 
 
 		 427 aa  107  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  41.55 
 
 		 522 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  36.73 
 
 		 512 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  35.66 
 
 		 513 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  32.17 
 
 		 512 aa  99  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  50.56 
 
 		 462 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  33.79 
 
 		 512 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  33.79 
 
 		 512 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  33.33 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  33.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  33.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  33.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>