28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0337 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0337  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 361 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3753  hypothetical protein  98.06 
 
 		 361 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3652  hypothetical protein  95.01 
 
 		 361 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.164535  hitchhiker  0.0000282332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0337  GntR family transcriptional regulator  98.34 
 
 		 361 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.467081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3845  hypothetical protein  99.72 
 
 		 361 aa  727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3571  hypothetical protein  99.72 
 
 		 361 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  52.2 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0179  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  50.42 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  29.1 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  27.86 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  27.86 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  28.88 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  29.11 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  28.07 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  28.87 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  28.22 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.09 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  31.28 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  28.19 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  35 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2339  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  26.26 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  28.33 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  27.47 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1453  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  28.74 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  25.3 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.04 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  29.57 
 
 		 399 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  25.12 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>