21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3652 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3571  hypothetical protein  95.29 
 
 		 361 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3845  hypothetical protein  95.29 
 
 		 361 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0337  GntR family transcriptional regulator  94.46 
 
 		 361 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.467081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3652  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.164535  hitchhiker  0.0000282332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0337  putative transcriptional regulator, GntR family  95.01 
 
 		 361 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3753  hypothetical protein  94.18 
 
 		 361 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  52.5 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0179  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  51.25 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  28.73 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  26.87 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  26.87 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  28.88 
 
 		 394 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  32.81 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  35.8 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0618  aminotransferase class V  27.72 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  25.99 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  25.99 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.98 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  27.47 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.47 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  26.24 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>