24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3753 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0337  putative transcriptional regulator, GntR family  98.06 
 
 		 361 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3753  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3652  hypothetical protein  94.18 
 
 		 361 aa  656    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.164535  hitchhiker  0.0000282332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0337  GntR family transcriptional regulator  99.17 
 
 		 361 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.467081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3845  hypothetical protein  98.34 
 
 		 361 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3571  hypothetical protein  97.78 
 
 		 361 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  51.65 
 
 		 364 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0179  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  50.42 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  29.1 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  28.36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  28.36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  27.36 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  27.36 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.09 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  29.34 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  28.4 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2339  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  26.26 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  27.98 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  26.92 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.04 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  27.72 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.94 
 
 		 406 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1453  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  27.81 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  29.34 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>