More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0980 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0980  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.746641  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0147  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  93.84 
 
 
295 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0510279  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1209  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75.26 
 
 
291 aa  457  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.56 
 
 
290 aa  443  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.03 
 
 
291 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2882  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha  70.21 
 
 
293 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  68.71 
 
 
294 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0827  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  69.18 
 
 
293 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.623831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.71 
 
 
294 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.71 
 
 
294 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1212  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.85 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.24 
 
 
291 aa  410  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.92 
 
 
292 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  65.76 
 
 
296 aa  401  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.26 
 
 
291 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3397  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.12 
 
 
293 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.57 
 
 
278 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  68.29 
 
 
290 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.37 
 
 
288 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3512  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.69 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.42 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0558  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.39 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0230  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.53 
 
 
294 aa  391  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
295 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.47 
 
 
290 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30915  predicted protein  68.49 
 
 
344 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0968  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  65.29 
 
 
290 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.73 
 
 
299 aa  387  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  66.1 
 
 
291 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.53 
 
 
294 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.53 
 
 
294 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0539  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.19 
 
 
294 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4358  succinyl-CoA synthetase, subunit alpha  70.34 
 
 
290 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.16 
 
 
294 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  65.65 
 
 
294 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  67.94 
 
 
290 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2163  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.19 
 
 
294 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.07 
 
 
290 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1618  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.94 
 
 
294 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161145  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.6 
 
 
290 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
290 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0279  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.97 
 
 
294 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0600383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0921  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.85 
 
 
294 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.97 
 
 
294 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0543  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.29 
 
 
294 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.72 
 
 
290 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.72 
 
 
290 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  67.25 
 
 
290 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.9 
 
 
290 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.72 
 
 
290 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
290 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.25 
 
 
290 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1125  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.19 
 
 
294 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0337157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
300 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
291 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
291 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0421  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  63.95 
 
 
294 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1645  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.07 
 
 
295 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  0.44525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.64 
 
 
293 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
300 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1927  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.07 
 
 
295 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0416872  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.9 
 
 
290 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0956  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.67 
 
 
290 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1585  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.85 
 
 
294 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.16 
 
 
290 aa  381  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29730  Succinyl-CoA ligase, alpha subunit  64.85 
 
 
295 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
294 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.02 
 
 
289 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.2 
 
 
295 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
293 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
294 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.29 
 
 
290 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
290 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
290 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.25 
 
 
295 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.25 
 
 
295 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
294 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.32 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.32 
 
 
289 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
294 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>