More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2293 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2293  PP-loop domain protein  100 
 
 		 248 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0147  PP-loop domain-containing protein  75.1 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0244  hypothetical protein  72.98 
 
 		 250 aa  390  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2160  PP-loop domain protein  63.07 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3474  PP-loop domain protein  55.79 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1080  PP-loop domain protein  52.92 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  37.08 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  36.86 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  33.82 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  33.33 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  33.33 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  34.39 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  32.02 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  34.72 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  32.89 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  31.84 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  31.65 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  31.11 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  35.09 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  35.09 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  33.83 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  32.37 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  32.08 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  32.69 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 326 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 331 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  31.9 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  31.62 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  31.9 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  31.94 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  31.94 
 
 		 317 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  28.45 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  31.2 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  31.94 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  32.19 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  31.47 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  32.83 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  32.83 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  31.9 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  31.9 
 
 		 274 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  32.49 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  31.53 
 
 		 302 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  28.51 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  32.09 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  29.74 
 
 		 310 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  32.02 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  31.03 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  30 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  30.17 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  30.8 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  30.6 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  30.6 
 
 		 336 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  30.13 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  30.09 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  29.31 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  30.09 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  31.88 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  31.22 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  30.6 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  29.31 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  29.95 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  29.74 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  29.31 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  29.74 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  27.88 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  30.56 
 
 		 368 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  30.41 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  32.32 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  29.31 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  30.19 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  29.31 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  32.02 
 
 		 326 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  32.14 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  29.07 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  29.74 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  32.43 
 
 		 305 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  31.31 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  30.11 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  29.46 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  30.14 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  29.86 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  28.84 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  29.27 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  29.49 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  30.32 
 
 		 311 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>