More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1433 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1433  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  842    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0460  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
392 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.178491  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3126  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.88 
 
 
389 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 
379 aa  203  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
395 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
395 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
387 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
387 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.29 
 
 
387 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.06 
 
 
387 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
382 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  28.6 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.83 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.83 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.6 
 
 
387 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  28.15 
 
 
387 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
386 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
382 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
388 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  32.51 
 
 
395 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  29.97 
 
 
381 aa  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  27.34 
 
 
381 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
383 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
398 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
395 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  30.23 
 
 
381 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
389 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 
395 aa  143  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
395 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  32.85 
 
 
395 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
390 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
388 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 
390 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 
402 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  25.11 
 
 
390 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  26.02 
 
 
390 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  30.69 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  30.95 
 
 
394 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
393 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
384 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  27.06 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.89 
 
 
391 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
382 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
389 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  30.06 
 
 
384 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  31.36 
 
 
399 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1013  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
386 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.74 
 
 
540 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
385 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1352  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
385 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.47 
 
 
414 aa  117  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
385 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.07 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
391 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  26.32 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.39 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  26.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  26.73 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.43 
 
 
382 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  26.08 
 
 
387 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
387 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
387 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.03 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.03 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3566  NADH-dependent butanol dehydrogenase A, C-terminus  26.42 
 
 
270 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.68 
 
 
387 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
390 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>