73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0017 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  88 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0022  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0016  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 		 367 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0001  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    96.43 
 
 		 380 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0041  tRNA-Ala  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.910553  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  RSPH17029_0a  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.158501  normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    96.15 
 
 		 360 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    96.15 
 
 		 364 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>