12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0001 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0001  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0016  tRNA-OTHER  98.26 
 
 		 115 bp  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0034  tRNA-OTHER  94.83 
 
 		 116 bp  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  RSPH17029_0a  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.158501  normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>