29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSPH17029_0a on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  RSPH17029_0a  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.158501  normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0023  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0001  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0016  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390119  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0021  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0053  tRNA-Met  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>