More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2756 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  69.93 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  64.46 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  61.09 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.52 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 300 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.52 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  47.26 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.86 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  47 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.52 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.19 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  42.71 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  42.57 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  41.44 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  41.44 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  39.73 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  39.73 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  39.33 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  42.41 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  39.18 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  41.32 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.82 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  40.97 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  35.97 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  40.97 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  35.97 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  40.62 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  40.97 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  40.83 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  40.83 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  38.28 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  40.83 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  40.83 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  40.83 
 
 		 298 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  40.33 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  40.48 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.93 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.93 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  40.14 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  36.39 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  42.4 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  39.22 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  39.79 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  34.52 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  34.8 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.87 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  34.66 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  39.39 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.23 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  32.58 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.21 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  33.67 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  35.2 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  32.92 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  31.19 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  33.81 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  30.66 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  32.03 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  33.98 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  31.16 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  31.43 
 
 		 320 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  32.14 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  31.37 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  32.36 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  30.59 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  32.59 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  31.72 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  31.95 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  31.51 
 
 		 348 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  30.97 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  31.6 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.48 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  33.22 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  30.29 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  34.11 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  32.12 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  29.07 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02910  aryl-alcohol dehydrogenase, putative  29.53 
 
 		 357 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.345326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  34.3 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>