More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1536 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  100 
 
 
298 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  98.99 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  98.99 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  99.66 
 
 
298 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  99.33 
 
 
298 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  88.93 
 
 
298 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  88.93 
 
 
298 aa  564  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  88.93 
 
 
298 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  88.93 
 
 
298 aa  564  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  88.93 
 
 
298 aa  564  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  88.59 
 
 
298 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  88.59 
 
 
298 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  88.26 
 
 
298 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  84.9 
 
 
298 aa  534  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  74.5 
 
 
298 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  70.81 
 
 
298 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  70.81 
 
 
298 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  70.47 
 
 
298 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  56.62 
 
 
302 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.14 
 
 
307 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  56.95 
 
 
302 aa  363  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  60.21 
 
 
296 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  59.86 
 
 
296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  59.17 
 
 
296 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
296 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
296 aa  351  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  54.15 
 
 
301 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  58.48 
 
 
296 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
296 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.21 
 
 
296 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  52.49 
 
 
304 aa  332  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  56.4 
 
 
296 aa  332  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.16 
 
 
300 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.49 
 
 
300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.49 
 
 
300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.49 
 
 
300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.49 
 
 
300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.1 
 
 
300 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.49 
 
 
300 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.49 
 
 
300 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  52.49 
 
 
300 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.76 
 
 
300 aa  322  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  48.82 
 
 
298 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  52.26 
 
 
296 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.36 
 
 
301 aa  288  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  50.34 
 
 
299 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
296 aa  279  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
305 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
302 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
302 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  43.54 
 
 
295 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  39.86 
 
 
293 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  37.18 
 
 
290 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
296 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  40.2 
 
 
302 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  36.21 
 
 
291 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
296 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
305 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  35.62 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
324 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.5 
 
 
304 aa  178  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  38.33 
 
 
287 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
305 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  36.98 
 
 
305 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  35.46 
 
 
305 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  36.84 
 
 
310 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  31.44 
 
 
297 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  35.61 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  37.41 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  35.06 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  34.8 
 
 
305 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  35.11 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  33.76 
 
 
305 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  36.75 
 
 
326 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.15 
 
 
301 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.45 
 
 
325 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  35 
 
 
325 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  33.33 
 
 
303 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  31.48 
 
 
320 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  34.64 
 
 
311 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  33.88 
 
 
309 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  34.44 
 
 
311 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
317 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  33.67 
 
 
304 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  33.21 
 
 
330 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  33.45 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
283 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  34.3 
 
 
319 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
325 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
333 aa  99.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  33.45 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  29.8 
 
 
331 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  32.07 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>