More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3037 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  100 
 
 
330 aa  673    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  82.37 
 
 
313 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  50 
 
 
323 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  49.37 
 
 
325 aa  309  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  48.2 
 
 
301 aa  285  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.54 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  48.71 
 
 
324 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
326 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  41.04 
 
 
305 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  37.9 
 
 
305 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
304 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
305 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
305 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.33 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  37.66 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  39.93 
 
 
309 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  37.3 
 
 
305 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  35.37 
 
 
303 aa  192  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.59 
 
 
300 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
300 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.81 
 
 
300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  37.63 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
300 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
300 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
300 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  36.77 
 
 
296 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.05 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.25 
 
 
300 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  32.79 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  33.45 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.25 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  36.08 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  37.76 
 
 
310 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  36.51 
 
 
295 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  36.11 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  33.77 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  32.79 
 
 
296 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  34.62 
 
 
301 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
296 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
309 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  37.17 
 
 
347 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
296 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
296 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  34.17 
 
 
296 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  32.78 
 
 
291 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  31.63 
 
 
320 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  32.55 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  32.12 
 
 
302 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
296 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  32.9 
 
 
302 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  29.84 
 
 
296 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.92 
 
 
296 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  34.95 
 
 
298 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  31.29 
 
 
348 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  34.6 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
290 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.18 
 
 
307 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
283 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  33 
 
 
298 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  31.6 
 
 
302 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  33.91 
 
 
298 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  33.91 
 
 
298 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
298 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  33.56 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  34.26 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  33.77 
 
 
298 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  33.22 
 
 
298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  37.63 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.99 
 
 
298 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  32.76 
 
 
298 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.99 
 
 
298 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  32.99 
 
 
298 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  30.89 
 
 
293 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
302 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
302 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.49 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  34.52 
 
 
319 aa  142  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  30.03 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  30.95 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  31.75 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  31.93 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  29.58 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  29.68 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>