More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0442 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  100 
 
 		 296 aa  617  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  70.61 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  70.61 
 
 		 296 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  70.27 
 
 		 296 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  70.61 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  68.24 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  67.91 
 
 		 296 aa  417  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  67.22 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  67.57 
 
 		 296 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.15 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.77 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  58.13 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  58.13 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  54.73 
 
 		 301 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.72 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.72 
 
 		 300 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  52.9 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.56 
 
 		 300 aa  341  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.56 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.56 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.56 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.9 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.9 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.56 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  54.73 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  56.4 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  56.4 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  56.4 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  56.4 
 
 		 298 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  56.4 
 
 		 298 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  50.52 
 
 		 304 aa  329  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  55.41 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  55.07 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  55.07 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  55.36 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.36 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.36 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  55.07 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  52.05 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  50.52 
 
 		 299 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.15 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  44.93 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  43.49 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  46.62 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  41.5 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  41.5 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  42.47 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  39.6 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  34.97 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  36.51 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  37.63 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  38.61 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  38.75 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  34.84 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  33.66 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  36.18 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  35.59 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  34.42 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.59 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  34.35 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  35.71 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  33.9 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  34.34 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  35.14 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  34.41 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  33.22 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  32.58 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  32.47 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.71 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  35.23 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  32.77 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  32.68 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  31.33 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  30.94 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  33.09 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  30.14 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  29.27 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.69 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  28.08 
 
 		 331 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  25.67 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>