More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0378 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  100 
 
 
307 aa  634    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  80.4 
 
 
302 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  79.73 
 
 
302 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  75.75 
 
 
301 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  64.69 
 
 
304 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  61.15 
 
 
298 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.15 
 
 
298 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  58.45 
 
 
296 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  59.17 
 
 
296 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
296 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  58.11 
 
 
296 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  59.14 
 
 
298 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.64 
 
 
298 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  57.43 
 
 
296 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  59.47 
 
 
298 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  57.77 
 
 
296 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  58.13 
 
 
296 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  57.77 
 
 
296 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  59.8 
 
 
298 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  59.47 
 
 
298 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  59.14 
 
 
298 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  58.8 
 
 
298 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  59.8 
 
 
298 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  58.14 
 
 
298 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  58.14 
 
 
298 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  58.14 
 
 
298 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  58.14 
 
 
298 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  58.14 
 
 
298 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  58.14 
 
 
298 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  57.81 
 
 
298 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.08 
 
 
296 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  57.48 
 
 
298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  55.29 
 
 
298 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.49 
 
 
300 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.76 
 
 
300 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.83 
 
 
300 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.41 
 
 
300 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.49 
 
 
300 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.5 
 
 
300 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.5 
 
 
300 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.5 
 
 
300 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
300 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.5 
 
 
300 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  52.6 
 
 
296 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  49.66 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  47.16 
 
 
298 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.53 
 
 
301 aa  291  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
296 aa  271  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  46.1 
 
 
295 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  43.52 
 
 
305 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
302 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
302 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  40.34 
 
 
296 aa  215  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  39.41 
 
 
302 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
291 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  37.29 
 
 
297 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  35.91 
 
 
293 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  39.04 
 
 
296 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  34.93 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  38.64 
 
 
296 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
287 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  36.84 
 
 
304 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
305 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
323 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  34.77 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
325 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
325 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.55 
 
 
301 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
324 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
326 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  37.37 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
291 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  31.37 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
305 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  37.14 
 
 
304 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  33.33 
 
 
311 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  31.71 
 
 
305 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
305 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
308 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
305 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  32.58 
 
 
309 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  33.33 
 
 
303 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  31.55 
 
 
330 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
311 aa  148  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
310 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
305 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.03 
 
 
304 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
309 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  29.48 
 
 
320 aa  135  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  29.26 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  29.02 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  31.85 
 
 
347 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  33.09 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.48 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>