More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4106 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  52.74 
 
 		 297 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  40 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  38.62 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  39.25 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.39 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  40.34 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.39 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  38.23 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  37.07 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  38.23 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  40 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.73 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.05 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  39.1 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.05 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.05 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.05 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.39 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.71 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  38.75 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  38.75 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.52 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  37.23 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  38.06 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  38.14 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  38.21 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  34.74 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  36.55 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  35.86 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  36.21 
 
 		 298 aa  195  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  36.21 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  36.21 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  36.21 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  35.86 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  35.86 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  36.21 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  35.86 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  35.86 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  35.86 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  36.21 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.68 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  36.68 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.68 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  35.52 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  34.46 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  34.62 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  36.4 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.58 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.42 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  33.87 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  35.59 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  32.19 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  35 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  33.12 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  33.81 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  32.89 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  31.12 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  33.91 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  35.66 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  31.1 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  29.84 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  32.57 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  32.25 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  30.03 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  31.33 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  33.68 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  32.65 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  30.25 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  30.58 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  29.34 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.65 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  30 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  31.66 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  33.2 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  30.46 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  31.17 
 
 		 337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  30.7 
 
 		 329 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.68 
 
 		 342 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  31.95 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  29.84 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>