More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0172 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  100 
 
 		 317 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  59.56 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  51.74 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  51.74 
 
 		 305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 305 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  49.84 
 
 		 303 aa  325  8.000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  49.21 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  46.37 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  50.78 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  47.87 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.47 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  46.23 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  44.16 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  45.62 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  43.89 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  42.63 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  38.48 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  38.05 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.36 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  31.11 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  32.38 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  31.1 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  31.8 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  31.08 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  31.46 
 
 		 302 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.48 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  30.86 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  31.08 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  30.77 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  30.77 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.79 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  29.34 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  30.26 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.79 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  29.79 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  30.89 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.18 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  30.46 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  31.08 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  31.08 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  31.08 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  28.8 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  31.08 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  31.08 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  32.28 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  30.77 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  29.52 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  30.25 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.34 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  29.72 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  30.27 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  31.73 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  30 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  32.06 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  31.72 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  29.75 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  30.14 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.02 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.7 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  29.01 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.63 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.99 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  29.91 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  28.96 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  29.18 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  30.48 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  28.3 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  30.18 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  27.03 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  26.47 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  28.75 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 368 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.15 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>