More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1875 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 298 aa  618  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  100 
 
 		 298 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  99.66 
 
 		 298 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  82.21 
 
 		 298 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  75.17 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  73.15 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  73.15 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  73.49 
 
 		 298 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  73.15 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  73.15 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  73.15 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  72.82 
 
 		 298 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  71.14 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  72.82 
 
 		 298 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  70.81 
 
 		 298 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  70.81 
 
 		 298 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  70.81 
 
 		 298 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  70.81 
 
 		 298 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.15 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  61.25 
 
 		 296 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  58.98 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  58.64 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  59.86 
 
 		 296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  59.86 
 
 		 296 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  59.52 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  59.52 
 
 		 296 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  59.17 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  59.17 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  56.42 
 
 		 301 aa  351  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.07 
 
 		 296 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.14 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.1 
 
 		 300 aa  331  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.1 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.1 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.1 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.1 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.1 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.79 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.76 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  52.41 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  53.38 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  54.27 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  55.36 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  54.01 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  48.65 
 
 		 298 aa  301  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.5 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  44.9 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  44.9 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  45.18 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  42.71 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  39.93 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  40.97 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  40.14 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  36.68 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  41.01 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  36.4 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  39.16 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  37.18 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  33.87 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  32.65 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  36.1 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.37 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  34.95 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  35.48 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  38.21 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  34.23 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  34.52 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.17 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  33.67 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  35.64 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  35.97 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  36.27 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  34.93 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  37.12 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  33.55 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  34.6 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  34.55 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  34.55 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  34.59 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  35.1 
 
 		 304 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  34.66 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  33.22 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  31.4 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  32 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  30.14 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 		 334 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  30.19 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  29.11 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  32.65 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>