27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2629 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  54.65 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  47.67 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  47.67 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  47.67 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  37.18 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  34.94 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  33.71 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  31.94 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  33.73 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  34.88 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  43.94 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  39.62 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  36.07 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  29.87 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  30.86 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  30.49 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  33.33 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>