26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1370 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  91.21 
 
 		 91 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  46.51 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  45.24 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  48.19 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  45.24 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  46.91 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  42.65 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  41.18 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  48.21 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  41.67 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  45.16 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  43.1 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  44.07 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  35.48 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  37.08 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  37.68 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  46.34 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  43.48 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  43.48 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  43.48 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  42.22 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  36.07 
 
 		 108 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>